Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRP12Q9Y561 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms