Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXND1Q9Y4D7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms