Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms