Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRID1Q9ULK0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID1Q9ULK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRID1Q9ULK0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms