Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERG28Q9UKR5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms