Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLKQ9UBT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLKQ9UBT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLKQ9UBT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms