Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAE1Q9UBE0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms