Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP2Q9P2J9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP2Q9P2J9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms