Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NAPA-204ENST00000593905 548 ntTSL 312.75□□□□□ -0.375e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 NAPA-217ENST00000597778 3898 ntTSL 212.75□□□□□ -0.375e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.395e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.415e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.415e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 GAGE12H-201ENST00000381722 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.435e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TROAP-201ENST00000257909 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.485e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TROAP-204ENST00000546776 1011 ntTSL 312.02□□□□□ -0.495e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PPM1A-202ENST00000325658 4125 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.495e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SLC35E3-201ENST00000319429 453 ntTSL 211.9□□□□□ -0.55e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TROAP-214ENST00000551192 1469 ntTSL 211.84□□□□□ -0.515e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-209ENST00000601623 530 ntTSL 511.69□□□□□ -0.545e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 COX6B2-207ENST00000589467 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.545e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 MYO5C-209ENST00000560809 6076 ntTSL 211.49□□□□□ -0.575e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.585e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PTCD2-208ENST00000510676 1001 ntTSL 511.36□□□□□ -0.595e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SEC61G-205ENST00000460484 1227 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.595e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TROAP-205ENST00000547807 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.3□□□□□ -0.65e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 AC019117.2-203ENST00000636703 972 ntTSL 511.2□□□□□ -0.625e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RFC2-204ENST00000470266 881 ntTSL 511.11□□□□□ -0.635e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 C6orf203-204ENST00000625458 1146 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.75e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SLC20A2-210ENST00000522401 577 ntTSL 410.66□□□□□ -0.75e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 CATSPER2P1-204ENST00000439564 1579 ntBASIC10.53□□□□□ -0.725e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 XRCC2-202ENST00000495707 4728 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.755e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.795e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 CD99P1-202ENST00000430562 984 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.865e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PTCD2-206ENST00000503315 1440 ntTSL 29.67□□□□□ -0.865e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PPM1A-201ENST00000325642 1713 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.865e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PPM1A-205ENST00000528241 564 ntTSL 59.65□□□□□ -0.865e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-208ENST00000471616 1775 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.885e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SEC61G-207ENST00000480303 661 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.885e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RFC2-206ENST00000479105 957 ntTSL 59.53□□□□□ -0.885e-17■■■■■ 409.9
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UTP3Q9NQZ2 FAM47E-STBD1-202ENST00000514140 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.25□□□□□ -0.935e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP2-209ENST00000487796 1092 ntTSL 59.19□□□□□ -0.945e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SUPT6H-205ENST00000580471 578 ntTSL 29.18□□□□□ -0.945e-17■■■■■ 409.9
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UTP3Q9NQZ2 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.975e-17■■■■■ 409.9
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UTP3Q9NQZ2 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.035e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LATS1-206ENST00000542747 3284 ntTSL 58.44□□□□□ -1.065e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.065e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF81-203ENST00000376950 492 ntTSL 58.39□□□□□ -1.075e-17■■■■■ 409.9
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UTP3Q9NQZ2 PPP2R3A-203ENST00000447251 806 ntTSL 58.3□□□□□ -1.085e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.095e-17■■■■■ 409.9
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UTP3Q9NQZ2 CFDP1-202ENST00000562602 699 ntTSL 37.85□□□□□ -1.155e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 57.71□□□□□ -1.184e-65■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.185e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PPM1A-206ENST00000531143 1546 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.185e-17■■■■■ 409.9
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UTP3Q9NQZ2 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.425e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.435e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.475e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.535e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.565e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.695e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.735e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.795e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RXFP1-202ENST00000342048 3676 ntTSL 1 (best)3.77□□□□□ -1.815e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.825e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 409.2
UTP3Q9NQZ2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 409.2
UTP3Q9NQZ2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 409.2
UTP3Q9NQZ2 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 409.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 315.12■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 408.5
UTP3Q9NQZ2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-27■■■■■ 408.4
UTP3Q9NQZ2 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-27■■■■■ 408.4
UTP3Q9NQZ2 PIGG-206ENST00000503261 626 ntTSL 516.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 408
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.633e-12■■■■■ 407.3
UTP3Q9NQZ2 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 407
UTP3Q9NQZ2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 406.7
UTP3Q9NQZ2 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 406.7
UTP3Q9NQZ2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 405.7
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 319.54■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 404.7
UTP3Q9NQZ2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 404.7
UTP3Q9NQZ2 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 213.83□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 404.7
UTP3Q9NQZ2 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-38■■■■■ 403.7
UTP3Q9NQZ2 WBP11-204ENST00000543316 554 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-38■■■■■ 403.7
UTP3Q9NQZ2 WBP11-205ENST00000544764 564 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-38■■■■■ 403.7
UTP3Q9NQZ2 WBP11-202ENST00000535328 494 ntTSL 212.07□□□□□ -0.481e-38■■■■■ 403.7
UTP3Q9NQZ2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 403.6
UTP3Q9NQZ2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 403.6
UTP3Q9NQZ2 CBX4-204ENST00000495122 490 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 403
UTP3Q9NQZ2 KMT5A-205ENST00000461103 1000 ntTSL 222.46■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 402.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4131.3 ms