Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZCCHC17Q9NP64 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms