Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLSTN2Q9H4D0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms