Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIL1Q9H173 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIL1Q9H173 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms