Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39BQ9GZU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM39BQ9GZU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM39BQ9GZU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms