Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHACTR1Q9C0D0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHACTR1Q9C0D0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms