Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM3Q9BZL3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM3Q9BZL3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM3Q9BZL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms