Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDRT15Q96T59 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT15Q96T59 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms