Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
DCLRE1CQ96SD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms