Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNGAP1Q96PV0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNGAP1Q96PV0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms