Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF558Q96NG5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF558Q96NG5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms