Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRC1Q96M27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRRC1Q96M27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRC1Q96M27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms