Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC136Q96JN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms