Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MSANTD3Q96H12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSANTD3Q96H12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms