Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJA4Q8WW22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms