Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP33Q8TEY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP33Q8TEY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms