Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP28Q8NHY6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP28Q8NHY6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms