Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAAF3Q8N9W5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms