Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR16C5Q8N3Y7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR16C5Q8N3Y7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR16C5Q8N3Y7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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