Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD35Q8N283 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD35Q8N283 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD35Q8N283 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms