Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HACE1Q8IYU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms