Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA2Q8IWL1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA2Q8IWL1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms