Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR53Q7Z5U6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR53Q7Z5U6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms