Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q71RC1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q71RC1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q71RC1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q71RC1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q71RC1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q71RC1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q71RC1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q71RC1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q71RC1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q71RC1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q71RC1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q71RC1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q71RC1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q71RC1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q71RC1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q71RC1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q71RC1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Q71RC1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q71RC1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q71RC1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q71RC1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q71RC1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q71RC1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q71RC1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q71RC1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q71RC1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q71RC1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q71RC1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q71RC1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q71RC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q71RC1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q71RC1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q71RC1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q71RC1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q71RC1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q71RC1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q71RC1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q71RC1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q71RC1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q71RC1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms