Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MUC6Q6W4X9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC6Q6W4X9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms