Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC62Q6P9F0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC62Q6P9F0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms