Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TYW3Q6IPR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYW3Q6IPR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TYW3Q6IPR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms