Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP4Q6FHJ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP4Q6FHJ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms