Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39BQ5VTQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms