Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF19Q5T6S3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF19Q5T6S3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms