Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDK2Q58EX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK2Q58EX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms