Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KHDC1Q4VXA5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KHDC1Q4VXA5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms