Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3C1V9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3C1V9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3C1V9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3C1V9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3C1V9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3C1V9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3C1V9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3C1V9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3C1V9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3C1V9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3C1V9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3C1V9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3C1V9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3C1V9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3C1V9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3C1V9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3C1V9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3C1V9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3C1V9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Q3C1V9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3C1V9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3C1V9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3C1V9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3C1V9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q3C1V9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Q3C1V9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q3C1V9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3C1V9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3C1V9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3C1V9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3C1V9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3C1V9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3C1V9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3C1V9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3C1V9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3C1V9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Q3C1V9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q3C1V9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms