Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP5B1Q2VPB7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms