Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF4Q2M2E3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms