Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF2Q1L5Z9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF2Q1L5Z9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF2Q1L5Z9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms