Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC6Q16204 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC6Q16204 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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