Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PDE6HQ13956 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PDE6HQ13956 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PDE6HQ13956 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PDE6HQ13956 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDE6HQ13956 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PDE6HQ13956 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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