Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDNQ13061 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRDNQ13061 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDNQ13061 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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