Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNX1T1Q06455 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1T1Q06455 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms