Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1Q01196 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX1Q01196 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms