Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5Q00535 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms